Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK2P53671 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK2P53671 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms