Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1GP51170 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms