Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAPOLAP51003 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAPOLAP51003 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms