Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSEN1P49768 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSEN1P49768 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSEN1P49768 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms