Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPAP49450 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPAP49450 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CENPAP49450 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPAP49450 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPAP49450 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPAP49450 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPAP49450 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPAP49450 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPAP49450 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms