Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK8P49336 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK8P49336 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK8P49336 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK8P49336 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK8P49336 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK8P49336 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK8P49336 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK8P49336 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK8P49336 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK8P49336 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK8P49336 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK8P49336 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK8P49336 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK8P49336 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK8P49336 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK8P49336 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK8P49336 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK8P49336 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK8P49336 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK8P49336 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK8P49336 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK8P49336 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK8P49336 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK8P49336 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms