Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMAN1P49257 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMAN1P49257 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms