Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALDH1A3P47895 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALDH1A3P47895 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALDH1A3P47895 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms