Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD4P46934 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms