Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL35P42766 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL35P42766 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL35P42766 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL35P42766 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL35P42766 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL35P42766 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL35P42766 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms