Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPHP41219 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPHP41219 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPHP41219 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPHP41219 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPHP41219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPHP41219 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPHP41219 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRPHP41219 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPHP41219 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPHP41219 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPHP41219 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPHP41219 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPHP41219 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPHP41219 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPHP41219 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPHP41219 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms