Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL1P40616 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL1P40616 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL1P40616 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL1P40616 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL1P40616 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL1P40616 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL1P40616 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARL1P40616 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms