Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC1P35052 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC1P35052 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC1P35052 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC1P35052 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC1P35052 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC1P35052 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC1P35052 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC1P35052 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC1P35052 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC1P35052 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC1P35052 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPC1P35052 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPC1P35052 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPC1P35052 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPC1P35052 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms