Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCR1P32246 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR1P32246 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR1P32246 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR1P32246 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR1P32246 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR1P32246 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR1P32246 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR1P32246 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR1P32246 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR1P32246 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR1P32246 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR1P32246 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR1P32246 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR1P32246 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR1P32246 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR1P32246 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCR1P32246 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCR1P32246 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR1P32246 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR1P32246 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR1P32246 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR1P32246 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR1P32246 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms