Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTX2P32243 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
OTX2P32243 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTX2P32243 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTX2P32243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OTX2P32243 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 326.6 ms