Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HIBADHP31937 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIBADHP31937 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms