Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HOXC9P31274 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXC9P31274 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXC9P31274 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms