Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC8P31273 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC8P31273 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC8P31273 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms