Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VARSP26640 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VARSP26640 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VARSP26640 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VARSP26640 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VARSP26640 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VARSP26640 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VARSP26640 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VARSP26640 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VARSP26640 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VARSP26640 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VARSP26640 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VARSP26640 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VARSP26640 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VARSP26640 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VARSP26640 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VARSP26640 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VARSP26640 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VARSP26640 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VARSP26640 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VARSP26640 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VARSP26640 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VARSP26640 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VARSP26640 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VARSP26640 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms