Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3P25205 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3P25205 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3P25205 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3P25205 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM3P25205 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM3P25205 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM3P25205 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCM3P25205 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCM3P25205 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM3P25205 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM3P25205 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM3P25205 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms