Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPH2P23942 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPH2P23942 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPH2P23942 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms