Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HRCP23327 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HRCP23327 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HRCP23327 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HRCP23327 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HRCP23327 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HRCP23327 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HRCP23327 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HRCP23327 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HRCP23327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HRCP23327 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HRCP23327 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HRCP23327 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HRCP23327 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
HRCP23327 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HRCP23327 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HRCP23327 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HRCP23327 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HRCP23327 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HRCP23327 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
HRCP23327 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HRCP23327 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HRCP23327 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HRCP23327 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
HRCP23327 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HRCP23327 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HRCP23327 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HRCP23327 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HRCP23327 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HRCP23327 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HRCP23327 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HRCP23327 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HRCP23327 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HRCP23327 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HRCP23327 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HRCP23327 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HRCP23327 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HRCP23327 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HRCP23327 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HRCP23327 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HRCP23327 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HRCP23327 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HRCP23327 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HRCP23327 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HRCP23327 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HRCP23327 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HRCP23327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
HRCP23327 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HRCP23327 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HRCP23327 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms