Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRM3P20309 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRM3P20309 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRM3P20309 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms