Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI1P19237 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI1P19237 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI1P19237 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms