Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EGR1P18146 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EGR1P18146 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EGR1P18146 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EGR1P18146 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EGR1P18146 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EGR1P18146 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EGR1P18146 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EGR1P18146 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms