Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARF4P18085 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARF4P18085 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARF4P18085 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARF4P18085 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARF4P18085 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARF4P18085 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARF4P18085 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARF4P18085 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARF4P18085 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARF4P18085 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARF4P18085 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARF4P18085 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARF4P18085 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARF4P18085 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARF4P18085 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARF4P18085 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARF4P18085 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARF4P18085 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARF4P18085 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARF4P18085 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF4P18085 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF4P18085 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARF4P18085 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms