Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XBP1P17861 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XBP1P17861 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XBP1P17861 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XBP1P17861 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XBP1P17861 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XBP1P17861 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XBP1P17861 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XBP1P17861 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XBP1P17861 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XBP1P17861 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XBP1P17861 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
XBP1P17861 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XBP1P17861 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms