Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFKLP17858 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKLP17858 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKLP17858 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKLP17858 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKLP17858 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKLP17858 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKLP17858 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKLP17858 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKLP17858 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKLP17858 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFKLP17858 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFKLP17858 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKLP17858 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKLP17858 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKLP17858 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKLP17858 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PFKLP17858 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKLP17858 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PFKLP17858 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms