Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DESP17661 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DESP17661 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DESP17661 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DESP17661 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DESP17661 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DESP17661 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DESP17661 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DESP17661 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DESP17661 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DESP17661 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DESP17661 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DESP17661 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DESP17661 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms