Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB4P17483 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB4P17483 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB4P17483 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms