Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLS3P13797 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLS3P13797 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLS3P13797 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLS3P13797 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLS3P13797 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLS3P13797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLS3P13797 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLS3P13797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLS3P13797 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLS3P13797 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLS3P13797 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLS3P13797 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLS3P13797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLS3P13797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLS3P13797 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLS3P13797 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLS3P13797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLS3P13797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLS3P13797 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLS3P13797 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLS3P13797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLS3P13797 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLS3P13797 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLS3P13797 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms