Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARGP13631 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARGP13631 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARGP13631 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARGP13631 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARGP13631 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARGP13631 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARGP13631 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARGP13631 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARGP13631 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARGP13631 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARGP13631 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms