Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIP12755 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIP12755 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIP12755 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIP12755 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIP12755 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIP12755 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIP12755 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIP12755 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIP12755 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIP12755 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIP12755 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIP12755 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIP12755 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIP12755 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIP12755 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms