Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PYGBP11216 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PYGBP11216 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PYGBP11216 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PYGBP11216 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PYGBP11216 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PYGBP11216 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PYGBP11216 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYGBP11216 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYGBP11216 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYGBP11216 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYGBP11216 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms