Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFB3P10600 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFB3P10600 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFB3P10600 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms