Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PKHD1P08F94 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PKHD1P08F94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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