Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD63P08962 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD63P08962 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD63P08962 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD63P08962 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD63P08962 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD63P08962 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD63P08962 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD63P08962 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD63P08962 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD63P08962 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD63P08962 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD63P08962 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD63P08962 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CD63P08962 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD63P08962 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD63P08962 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD63P08962 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms