Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MGPP08493 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MGPP08493 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MGPP08493 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MGPP08493 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MGPP08493 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MGPP08493 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MGPP08493 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MGPP08493 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MGPP08493 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MGPP08493 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MGPP08493 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MGPP08493 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms