Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGAVP06756 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAVP06756 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms