Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLBP06746 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLBP06746 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLBP06746 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLBP06746 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLBP06746 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLBP06746 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLBP06746 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLBP06746 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLBP06746 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLBP06746 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLBP06746 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLBP06746 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLBP06746 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLBP06746 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLBP06746 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLBP06746 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLBP06746 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLBP06746 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLBP06746 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLBP06746 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLBP06746 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLBP06746 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms