Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCGP05129 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCGP05129 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms