Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPN2P04844 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPN2P04844 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPN2P04844 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPN2P04844 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPN2P04844 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPN2P04844 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPN2P04844 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN2P04844 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN2P04844 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN2P04844 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN2P04844 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPN2P04844 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN2P04844 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPN2P04844 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPN2P04844 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPN2P04844 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPN2P04844 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPN2P04844 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPN2P04844 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms