Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F9P00740 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
F9P00740 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F9P00740 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F9P00740 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F9P00740 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F9P00740 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F9P00740 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F9P00740 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F9P00740 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F9P00740 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F9P00740 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F9P00740 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F9P00740 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F9P00740 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F9P00740 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
F9P00740 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F9P00740 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F9P00740 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F9P00740 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F9P00740 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
F9P00740 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F9P00740 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F9P00740 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
F9P00740 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F9P00740 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F9P00740 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F9P00740 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F9P00740 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F9P00740 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F9P00740 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F9P00740 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms