Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN7O95471 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms