Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PCF11O94913 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PCF11O94913 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCF11O94913 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCF11O94913 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCF11O94913 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCF11O94913 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PCF11O94913 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCF11O94913 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCF11O94913 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCF11O94913 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCF11O94913 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCF11O94913 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCF11O94913 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PCF11O94913 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCF11O94913 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PCF11O94913 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCF11O94913 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PCF11O94913 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCF11O94913 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCF11O94913 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCF11O94913 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCF11O94913 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PCF11O94913 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCF11O94913 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PCF11O94913 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCF11O94913 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCF11O94913 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCF11O94913 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PCF11O94913 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PCF11O94913 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PCF11O94913 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCF11O94913 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PCF11O94913 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCF11O94913 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCF11O94913 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
PCF11O94913 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCF11O94913 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms