Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFASCO94856 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFASCO94856 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFASCO94856 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFASCO94856 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFASCO94856 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFASCO94856 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFASCO94856 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFASCO94856 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFASCO94856 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFASCO94856 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFASCO94856 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFASCO94856 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFASCO94856 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFASCO94856 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFASCO94856 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFASCO94856 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFASCO94856 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFASCO94856 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFASCO94856 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFASCO94856 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFASCO94856 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFASCO94856 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFASCO94856 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFASCO94856 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFASCO94856 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFASCO94856 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFASCO94856 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFASCO94856 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms