Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB3O75712 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB3O75712 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB3O75712 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB3O75712 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB3O75712 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB3O75712 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB3O75712 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB3O75712 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB3O75712 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB3O75712 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB3O75712 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB3O75712 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB3O75712 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB3O75712 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB3O75712 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB3O75712 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB3O75712 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB3O75712 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB3O75712 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB3O75712 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms