Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKAP2O75563 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKAP2O75563 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP2O75563 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms