Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CILPO75339 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CILPO75339 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CILPO75339 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CILPO75339 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CILPO75339 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CILPO75339 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CILPO75339 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CILPO75339 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CILPO75339 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CILPO75339 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CILPO75339 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CILPO75339 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CILPO75339 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CILPO75339 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CILPO75339 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CILPO75339 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CILPO75339 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CILPO75339 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CILPO75339 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CILPO75339 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CILPO75339 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CILPO75339 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CILPO75339 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CILPO75339 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CILPO75339 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms