Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH16O75309 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH16O75309 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH16O75309 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH16O75309 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH16O75309 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH16O75309 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH16O75309 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms